員工出差過程中發(fā)生的相關費用與差旅費補助是兩個概念。員工出差過程中發(fā)生的相關費用屬于與企業(yè)經營相關的費用，如員工墊付費用，企業(yè)可以根據實際情況報銷，同時根據《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》及其實施條例的規(guī)定，企業(yè)發(fā)生的與取得收入直接相關的、符合生產經營常規(guī)的必要和正常的支出，準予在計算應納稅所得額時扣除。企業(yè)所得稅稅前扣除應符合三個基本原則：真實性、相關性、合理性。真實性是稅前扣除的首要原則，要求納稅人提供證明支出確屬實際發(fā)生的合法、有效憑證。

　　企業(yè)支付給員工的差旅費補助是對員工的額外現金補助，屬于工資、薪金的一部分。關于差旅費補助的標準由財政部門制定，目前對企業(yè)無具體標準，僅對中央和國家機關以及參照公務員法管理的事業(yè)單位有明確的規(guī)定，具體內容請參見《中央和國家機關差旅費管理辦法》(財行[2013]531號)。因此，對于行政事業(yè)單位按照財行[2013]531號文件規(guī)定的標準，發(fā)放給出差人員的差旅費包干補助，可按《國家稅務總局關于印發(fā)征收個人所得稅若干問題的規(guī)定的通知》(國稅發(fā)[1994]089號)第二條的規(guī)定，不予征收個人所得稅，超過標準的部分，應并入職工當月工資計征個人所得稅。