根據(jù)行政事業(yè)單位的機(jī)構(gòu)建制和經(jīng)費(fèi)領(lǐng)撥關(guān)系，行政事業(yè)單位的會(huì)計(jì)組織系統(tǒng)分為主管會(huì)計(jì)單位、二級(jí)會(huì)計(jì)單位和基層會(huì)計(jì)單位三級(jí)。

    主管會(huì)計(jì)單位（簡(jiǎn)稱“主管單位”），即向財(cái)政部門領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，并發(fā)生預(yù)算管理關(guān)系，有所屬會(huì)計(jì)單位的會(huì)計(jì)單位。也就是說(shuō)，主管會(huì)計(jì)單位直接向財(cái)政部門領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，有所屬會(huì)計(jì)單位并向其所屬會(huì)計(jì)單位轉(zhuǎn)撥經(jīng)費(fèi)。

    二級(jí)會(huì)計(jì)單位（簡(jiǎn)稱“二級(jí)單位”），即向主管會(huì)計(jì)單位或上一級(jí)會(huì)計(jì)單位領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，并發(fā)生預(yù)算管理關(guān)系，有下一級(jí)會(huì)計(jì)單位的會(huì)計(jì)單位。也就是說(shuō)，二級(jí)會(huì)計(jì)單位不直接向財(cái)政部門領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，而是向主管會(huì)計(jì)單位或上一級(jí)會(huì)計(jì)單位領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，有所屬會(huì)計(jì)單位并向其所屬會(huì)計(jì)單位轉(zhuǎn)撥經(jīng)費(fèi)。

    三級(jí)會(huì)計(jì)單位（也稱“基層會(huì)計(jì)單位”）。即向上一級(jí)會(huì)計(jì)單位領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，并發(fā)生預(yù)算管理關(guān)系，沒(méi)有下級(jí)會(huì)計(jì)單位的會(huì)計(jì)單位。向同級(jí)財(cái)政部門領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，沒(méi)有下級(jí)會(huì)計(jì)單位的，視同基層會(huì)計(jì)單位。也就是說(shuō)，不論是向財(cái)政部門領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，還是與主管會(huì)計(jì)單位或二級(jí)會(huì)計(jì)單位向上一級(jí)會(huì)計(jì)單位領(lǐng)報(bào)經(jīng)費(fèi)，只要沒(méi)有所屬會(huì)計(jì)單位的就是或者視同是基層會(huì)計(jì)單位。

    以上的會(huì)計(jì)單位，都應(yīng)建立獨(dú)立的單位預(yù)算，實(shí)行比較完整的會(huì)計(jì)核算制度。不具備獨(dú)立核算條件的，實(shí)行單據(jù)報(bào)賬制度，作為“報(bào)賬單位”管理。