（1）計(jì)算乙公司向SPV公司分配股息時(shí)應(yīng)代扣代繳的企業(yè)所得稅。

應(yīng)代扣代繳的企業(yè)所得稅=1000×10%=100（萬(wàn)元）。
按照《企業(yè)所得稅法》及其實(shí)施條例的規(guī)定，實(shí)行源泉扣繳的非居民企業(yè)取得的股息、紅利等權(quán)益性投資收益，減按10%的稅率征收企業(yè)所得稅。

（2）計(jì)算乙公司向甲公司支付商標(biāo)使用費(fèi)、咨詢(xún)費(fèi)、設(shè)計(jì)費(fèi)應(yīng)代扣代繳的增值稅。

應(yīng)代扣代繳的增值稅=（1000+800+5）/（1+6%）×6%=102.17（萬(wàn)元）。
扣繳義務(wù)人按照規(guī)定公式和適用稅率計(jì)算應(yīng)扣繳稅額：
應(yīng)扣繳稅額=購(gòu)買(mǎi)方支付的價(jià)款÷（1+稅率）×稅率

（3）計(jì)算乙公司向甲公司支付商標(biāo)使用費(fèi)、咨詢(xún)費(fèi)、設(shè)計(jì)費(fèi)應(yīng)代扣代繳的企業(yè)所得稅。

應(yīng)代扣代繳的企業(yè)所得稅=1000/（1+6%）×10%=94.34（萬(wàn)元）。
非居民企業(yè)取得股息、紅利等權(quán)益性投資收益和利息、租金、特許權(quán)使用費(fèi)所得應(yīng)繳納增值稅的，在計(jì)算繳納企業(yè)所得稅時(shí)，應(yīng)以不含增值稅的收入全額作為應(yīng)納稅所得額。
由于甲公司未派遣相關(guān)人員來(lái)中國(guó)提供咨詢(xún)和設(shè)計(jì)相關(guān)服務(wù)，所以咨詢(xún)費(fèi)和設(shè)計(jì)費(fèi)不屬于來(lái)源于中國(guó)的所得，不需要在我國(guó)繳納企業(yè)所得稅。

（4）指出乙公司上述對(duì)外支付的款項(xiàng)中，需要辦理稅務(wù)備案手續(xù)的項(xiàng)目有哪些，并說(shuō)明理由。

乙公司對(duì)外支付的股息、商標(biāo)使用費(fèi)、咨詢(xún)費(fèi)需要辦理稅務(wù)備案手續(xù)。
理由：境內(nèi)機(jī)構(gòu)和個(gè)人向境外單筆支付等值5萬(wàn)美元以上（不含等值5萬(wàn)美元）的外匯資金，除無(wú)須進(jìn)行稅務(wù)備案的情形外，均應(yīng)向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)進(jìn)行稅務(wù)備案。
5萬(wàn)美元=5×6.5=32.5（萬(wàn)元人民幣），乙公司對(duì)外支付的股息、商標(biāo)使用費(fèi)、咨詢(xún)費(fèi)均高于32.5萬(wàn)元人民幣，也就是高于5萬(wàn)美元，應(yīng)當(dāng)辦理稅務(wù)備案手續(xù)。

（5）判斷甲公司轉(zhuǎn)讓SPV公司的股權(quán)是否需要在中國(guó)繳納企業(yè)所得稅并說(shuō)明理由。

需要在境內(nèi)繳納企業(yè)所得稅。
理由：非居民企業(yè)通過(guò)實(shí)施不具有合理商業(yè)目的的安排，間接轉(zhuǎn)讓中國(guó)居民企業(yè)股權(quán)等財(cái)產(chǎn)，規(guī)避企業(yè)所得稅納稅義務(wù)的，應(yīng)按照《企業(yè)所得稅法》的有關(guān)規(guī)定，重新定性該間接轉(zhuǎn)讓交易，確認(rèn)為直接轉(zhuǎn)讓中國(guó)居民企業(yè)股權(quán)等財(cái)產(chǎn)，應(yīng)在中國(guó)境內(nèi)繳納企業(yè)所得稅。